‌پیکر امیر محققی صبح روز شنبه ۱۰ مهر ۱۴۰۰ در مراسمی با حضور فرمانده نهاجا و جمعی از مقامات عالی‌رتبه نظامی در بیمارستان بعثت تشییع شد.